Pues si, los pierdes. Generalmente viene a decir que inviertes esos puntos para ser de ese rango. Por si alguien está pensandolo, no pueden saltarse rangos, si quieren ser Jounin por ejemplo deben pasar por Genin, academia y todo el tinglado y esos no son cambios inmediatos como la academia o los personajes, esos serán mediante actividades para ver si pasan o no